6.1.1
ETAPAS DE SÍNTESIS DEL ARN
Etapas
en la síntesis del ARN Con la finalidad de ordenar el estudio de la
transcripción, dividiremos la misma en cuatro etapas fundamentales:
1° etapa- UNIÓN de la ARN polimerasa al ADN.
2° etapa- INICIACIÓN de la síntesis.
3° etapa- ELONGACIÓN de la cadena de ARN mensajero.
4°
etapa- TERMINACIÓN de la síntesis y liberación de la cadena de ARNm.
- Características de la ARN polimerasa procariota
La ARN polimerasa es una de las enzimas más grandes que se conoce.
Consta de cinco sub-unidades: dos alfa (α), beta (b), beta prima (b’) y
sigma (s). La
enzima completa es denominada Holoenzima y se divide en dos
componentes principales:
• La enzima central, denominada Core, formada por las sub unidades 2
α, b y b’’.
• El Factor Sigma ( el polipéptido s).
Los nombres indican que solamente la Holoenzima tiene la capacidad de
unirse a la cadena molde de ADN e iniciar la transcripción; pero una vez
realizada esta, el factor s es liberado, dejando que el Core continúe con la elongación. En
definitiva, es el factor s el
que le da la capacidad a la ARN polimerasa para poder iniciar la síntesis del
ARN mensajero en el sitio apropiado.
La Holoenzima reconoce un sitio de unión específico en el ADN, este
sitio es denominado Promotor.
Como consecuencia de lo dicho, la ADN polimerasa puede encontrarse en
dos
estados:
1) Un estado apropiado para la unión con el Promotor: “estado
de iniciación” u Holoenzima.
2) Un
estado apropiado para la elongación: Core de la enzima.
La ARN polimerasa es lo bastante grande como para tomar contacto con
muchas bases del ADN, así la enzima cubre aproximadamente unas 60 pb (pares de
bases), aunque el segmento de ADN desenrollado, y que sirve como molde,
comprende únicamente unos 17 pb.
- El Promotor Procariota: la señal de inicio
Se mencionó anteriormente que la ARN polimerasa se unía a un sitio
específico del ADN denominado Promotor. La enzima es capaz de
reconocer este sitio del ADN y, convenientemente, abrir localmente las cadenas
de ADN para poder leer la cadena molde. Es de esperarse entonces que, el sitio
de contacto con la Holoenzima tuviese regiones comunes a todos los Promotores.
Se ha comprobado que estos sitios mencionados contienen secuencias de
bases comunes, a las que se las ha denominado “Secuencias de Consenso”.
Por mera convención entre los científicos, se considera que el sentido
de la transcripción de un gen determinado es hacia la derecha. Al punto en el
cual se inicia este proceso se lo denomina “punto 0”. Con números
negativos se señalan las bases ubicadas a la izquierda del punto 0. Con el
mismo criterio, se señalan con números positivos a las bases ubicadas a la
derecha del punto 0.
La secuencia de consenso más importante y mejor estudiado, comprende
seis bases y su centro está ubicado a diez bases a la izquierda del punto de
inicio (-10). La secuencia de consenso es TATAAT y se la denomina “TATA
box o Caja Pribnox”. Esta caja es responsable de
orientar a la ARN polimerasa en la dirección de síntesis de ARN y es la región
en la cual la doble hélice se abre para formar el Complejo Promotor Abierto.
El hecho de que la TATA box contenga las bases A-T no es mera casualidad, ya que
estas se unen con sus complementarias por medio de dos enlaces del tipo Puente
de Hidrógeno, lo cual implica un menor gasto de energía para la apertura del
ADN.
INICIACIÓN De La Síntesis Del ARN Mensajero
La iniciación se produce mediante la unión de la ARN polimerasa (Holoenzima)
al ADN de doble cadena. Para que la cadena molde esté disponible para el
apareamiento de bases con los ribonucleótidos, las dos cadenas de ADN deben
separarse. El desenrollamiento es local y se produce cuando la Holoenzima
contacta con la TATA Box.
Una vez que el complejo promotor se encuentra abierto, la ARN pol.
Comienza la síntesis. La fase de iniciación no se completa hasta que se hallan
polimerizado los primeros seis ribonucleótidos.
ELONGACIÓN de la cadena
Después que se han colocado los primeros seis ribonucleótidos, la ARN
polimerasa sufre un cambio en su conformación, perdiendo la sub unidad _. Se
continúa la síntesis en el estado de Core anteriormente descrito.
El Core se mueve a lo largo del ADN colocando los ribonucleótidos
complementarios a la cadena de ADN molde, abriendo la hélice a medida que se
desplaza. Los ribonucleótidos se unen al extremo 3’ de la cadena de ARN en
crecimiento, formándose un Híbrido ARN-ADN en la región
desenrollada, el cual se mantiene estabilizado mediante enlaces puente de
Hidrógeno. El híbrido tiene una longitud aproximada de 12 pb y el nuevo ARN es
liberado de estas uniones cuando el ADN recupera su estado de doble hélice por
desplazamiento del Core.
TERNINACIÓN
y LIBERACIÓN del ARN sintetizado
La terminación ocurre en una secuencia determinada del ADN, denominada
Secuencia
Terminadora. En este punto, la enzima deja de añadir los
ribonucleótidos a la cadena de ARN en crecimiento, liberando el producto
terminado y disociándose del ADN.
La terminación requiere que todos los enlaces Puente de Hidrógeno, que
mantenían al Híbrido ARN – ADN, se rompan volviéndose a reconstituir el ADN
dúplex.
Las
secuencias terminadoras muestran las siguientes similitudes:
i) Todas contienen secuencias Palindrómicas justo antes del punto
de terminación. El palíndromo está caracterizado por poseer repeticiones inversas
conteniendo un segmento central no repetido (ej. ATCATCGACTA).
ii) La secuencia palindrómica continúa con una
secuencia de pares A-T, las cuales producen en el ARN mensajero una secuencia
de 6 a 8 Uracilos en el extremo transcripto.
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